Педиатрический университет осуществляет полный комплекс фундаментальных и научно-прикладных, педагогических исследований здоровья, психологической устойчивости, решения демографических, социальных и экономических проблем, биологической и экологической обстановки.

Научно-исследовательская деятельность Университета в настоящее время осуществляется через:

выполнение научно-исследовательских работ;
аспирантуру, докторантуру и соискательство;
патентно-лицензионную деятельность;
работу с федеральными и отраслевыми информационными фондами и базами данных;
научно-исследовательскую работу студентов и молодых ученых;
проведение конференций.

Научно-исследовательская деятельность Университета проводится по трем направлениям в рамках приоритетных задач, стоящих перед медицинской наукой и здравоохранением России:

Перинатальные проблемы болезней у детей, подростков и взрослых.
Влияние анатомо-функциональных, психосоматических и медико-социальных факторов на здоровье матери и ребенка.
Педиатрические аспекты предиктивно-превентивной и персонализированной медицины.

По данным на 30.07.2018 г. суммарное число публикаций сотрудников Университета в РИНЦ составило 21646 статей с общим количеством цитирований 118585. За последние 5 лет было опубликовано 8225 статей, из них 493 в зарубежных журналах, а число статей в журналах, входящих в Web of Science и Scopus составило 1640. Количество статей, опубликованных в российских и иностранных журналах, постоянно растет (2004–2008 гг. — 1145; 2009–2013 гг. — 2085, 2014–2017 гг. — 6818).

Научные статьи — http://elibrary.ru/org_profile.asp?id=5313

Актуальным является дальнейшее улучшение интегративных наукометрических показателей, как критериев результативности деятельности вуза. По индексу Хирша Педиатрический университет занимает 2-е место среди всех высших медицинских учреждений Минздрава России, 5-е место среди всех высших учебных заведений РФ, 15-е место среди всех организаций РФ (суммарный индекс Хирша по РИНЦ университета равен 144).

Наименование показателя	Период
Наименование показателя	2016 г.	2017 г.	2018 г.
Суммарный индекс Хирша	94	113
Суммарный импакт-индекс	485,270	567,430	698,5

По критериям результативности каждый год министерство проводит мониторинг различных показателей, в число которых научная деятельность входит отдельной строкой. Эффективность научной работы оценивается по количеству статей в изданиях, входящих в перечень ВАК, и зарубежных публикаций, числу патентов и грантов. По результатам ежегодного мониторинга министерства здравоохранения показатели Педиатрического университета наиболее высокие в городе, и из года в год по критериям научной деятельности мы улучшаем свои позиции.

Многие научные исследования, проводимые специалистами Университета, поддержаны грантами, как Российскими, так и Международными, и их число постоянно растет.

Гранты за 2015-2018 гг.

Учебный год	Кол-во грантов, в том числе студентов, аспирантов и молодых ученых	Сумма	В том числе студенты, аспиранты и молодые ученые
2015/2016	31/7	13 млн. 600 тыс. рублей	540 тыс. рублей
2016/2017	29/6	14 млн. 770 тыс. рублей	240 тыс. рублей
2017/2018	27/18 (в том числе стажировки за рубежом и стипендии)	17 млн. 676 тыс. рублей	1 млн. 76 тыс. рублей

Затраты на научные исследования и разработки в отчетном периоде:

Источники финансирования	2015 год	2016 год	2017
Бюджетные средства	15 963 400	92 629 200	7 257 677
Внебюджетные средства	72 629190	48 044435	53 642 888
ИТОГО	88 592590	140 673 630	60 900 575

Показатель	2015 г.	2016 г.	2017 г.
Заработанные средства от грантов и конкурсов	12 100 000,00	10 370 000,00	9 260 000,00
Заработанные средства от клинических исследований	5 187 751,93	8 335 310,29	13 526 256,00
Заработанные средства от клинической апробации	–	21 433 341,22	22 913 924,83
Заработанные средства от экспертной деятельности	–	–	-
Средства, полученные по государственному заданию по разделу «наука»	6 714 400,00	6 629 200,00	7 257 677,00

Возросшая научная активность находит отражение и в количестве полученных патентов на изобретения (2011/2012 гг. — 3 патента; 2012/2013 гг. — 11; 2013/2014 гг. — 19; 2014/2015 гг. — 20 патентов на изобретения, 2015/2016 гг. — 21 патент на изобретение, 2016/2017 – 20 патентов на изобретения, 2017/2018 – 23 патента на изобретения).

С 2014 г. появилась возможность доступа к информационным базам данных ClinicalKey и Scopus, с 2018 года Университет подключен к информационной базе Web of Science, что позволило обеспечить доступ сотрудников и студентов к результатам новейших исследований.

Организована работа по коммерциализации научных исследований через создание малых инновационных предприятий (МИП), участию в конкурсе Фонда Бортника.

Для поддержания высокого уровня научной работы на всех кафедрах и подразделениях Университета Научный отдел опирается на Проблемные комиссии, детально прорабатывающие все предлагаемые темы научно-исследовательских работ (НИР); на Научно-координационный совет, утверждающий рассмотренные на проблемных комиссиях НИР; на работу собственных подразделений: отдел аспирантуры и докторантуры (М.Ю. Дайнеко, С.Г.Мележик), оформление регистрационных карт и работа с РИНЦ (И.Л. Третенко), кабинет по охране интеллектуальной собственности (патентовед Н.Е. Ляпунова). При этом ежегодно ректоратом Университета проводится оценка научной активности кафедр и подразделений СПбГПМУ.

Большое значение придается работе студентов в научных кружках, организованных почти при всех кафедрах. Эта работа — одна из важнейших форм учебного процесса, призванная создать основу для дальнейшего развития науки, взращивания научных кадров. В кружках СНО студенты приобщаются к специфике научной работы, ведению эксперимента, а на клинических кафедрах еще и к более тесному контакту с больными, овладению клиническим мышлением. Научная тематика студенческих работ является частью исследований, проводимых коллективами кафедр. Совет СНО (научный руководитель — д.м.н. Г.О. Багатурия) ежегодно организует научные конференции, рекомендует лучшие работы для представления на межвузовские конференции. Многие студенты участвуют во всероссийских и международных конкурсах студенческих работ. Из студентов, активно работающих в СНО, формируются затем кадры будущих аспирантов и клинических ординаторов, многие преподаватели начали свой путь в науку со студенческого кружка.

Научно-исследовательский центр (НИЦ) является структурным подразделением научно-исследовательского отдела Университета. Произведена реорганизация работы НИЦ, как базы для проведения фундаментальных и прикладных исследований по направлениям «Нейрокогнитивные технологии» и «Биоинженерные органы».

В 2017–2018 г. Университетом проведены 16 международных конференций и съездов, 26 всероcсийских, 15 региональных и 19 городских научно-практических конференций и семинаров. Предлагаются новые формы проведения школ-семинаров для молодых ученых и специалистов.

С 2010 г. в Университете издается журнал «Педиатр». На страницах журнала объединена фундаментальная наука и практика, представлены последние перспективные исследования во всех направлениях медицины, прежде всего педиатрии, перинаталогии, неонаталогии, акушерства и гинекологии и пр., отражено инновационное движение отечественной медицинской науки и зарубежных достижений в медицине и биологии. Помимо русскоязычного сайта журнала «Педиатр» в конце 2013 г. появилась и англоязычная версия сайта, позволяющая пользоваться ею как читателям, так и потенциальным авторам публикаций, не владеющим русским языком. Журнал реферируется РЖ ВИНИТИ, внесен в список журналов ВАК, представлен в e-LIBRARY, планируется регистрация в международных базах данных (Scopus, Web of Science).

Основными партнерами СПбГПМУ по научному сотрудничеству являются: Институт биологии развития им. Н.К. Кольцова РАН, Институт эволюционной физиологии и биохимии им. И.М. Сеченова РАН, Институт высокомолекулярных соединений РАН, Институт экспериментальной медицины, Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера.